有些生物碱,如吗啡生物碱,可能具有麻醉作用,通常来自罂粟生物碱在植物中比较少见,它们有一种被认为是复杂的化学结构,并且总是含有一个氮分子。生物碱也可能含有氧、碳和氢的分子生物碱可用于瞳孔扩张,但其作用从药物到毒性各不相同,所有的生物碱都会对人体产生生理作用。有些生物碱,如麦角生物碱,可能有毒甚至致命。可卡因和咖啡因是两种植物性生物碱,据信它们的作用是有毒的。
有些生物碱可用于医疗目的,如治疗晕动病。许多生物碱可用于医疗目的。阿托品被认为在历史上曾被用作毒药,现在有时也被用作毒药东莨菪碱用于刺激中枢神经系统和扩大瞳孔。东莨菪碱是一种生物碱,常用于治疗运动病。奎宁是金鸡纳属植物中31种生物碱化合物之一,具有抗疟作用。奎宁仍然被用作治疗疟疾的首选药物。一些生物碱,如吗啡生物碱,会产生麻醉作用。这些生物碱通常来自罂粟。吗啡生物碱可能是世界上最古老的药物之一。大约在公元前3500年,苏美尔人就开始使用吗啡生物碱。从19世纪30年代起,吗啡生物碱经常被用于催眠,尽管人们认为吗啡生物碱会使人上瘾。今天,吗啡生物碱有时仍被用作药物镇痛剂,或者止痛药长春新碱是20世纪50年代首次从长春花中分离出来的生物碱,现在被用于治疗非霍奇金淋巴瘤和儿童白血病,长春碱也被认为是治疗霍奇金病的有效药物
许多生物碱具有麻醉作用。
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