什么是基因组数据库(Genome Database)?

基因组是一个有机体中所有遗传物质的集合。由于这些遗传物质的序列和结构决定了整个生物生命的发展,科学家们对找出它们的作用非常感兴趣。基因组数据库是一个或多个有机体的交叉引用信息集合,因此,一个科学家可以查看所...
基因组是一个有机体中所有遗传物质的集合。由于这些遗传物质的序列和结构决定了整个生物生命的发展,科学家们对找出它们的作用非常感兴趣。基因组数据库是一个或多个有机体的交叉引用信息集合,因此,一个科学家可以查看所有可用的遗传信息来帮助他或她进行研究。遗传学家可以使用基因组数据库来识别他们正在研究的基因,或者找出该基因的作用基因组是高度复杂的,在信息序列中包含数十亿个碱基。因此,计算机化数据库是在一个地方组织细节的唯一可行方法。一般来说,这些都可以作为科学研究的在线数据库,一个相对较新的科学领域,叫做生物信息学,已经出现了,它完善了通过计算机系统解释生物数据的方式基因组数据库包含一个有机体的基因序列,如果整个序列是已知的。否则,它可能包含部分序列。例如,人类、小鼠和果蝇基因组已经测序。当基因组序列已知时,遗传学家可以识别基因组中的特定基因。每个基因都是一种特定细胞产品的说明书如果一个基因发生突变,它与正常的功能基因有不同的序列。突变可能是有益的,并在突变的有机体中产生一个有用的特性。它们也可能对产品没有影响,也可能对生物体的正常工作有害。例如,许多医疗条件,突变也可以用来计算一个特定物种和另一个物种之间的密切关系,因为随着时间的推移,越来越多的突变累积在一起。个体的基因组序列也会发生变化,特别是大的基因组的一部分不是基因,也不编码任何必需的细胞产物。基因组数据库保存着一个有机体的序列,这个序列被指定为一个标准,但是任意选择的标准和一个物种中的其他个体之间会有许多微小的差别尽管存在许多差异,基因还是可以通过序列识别出来的。如果遗传学家知道某个特定基因在一个有机体中的作用,那么在另一个动物中具有相似序列的基因很可能具有相同的功能。遗传学家可以使用基因组数据库来识别他们正在研究的基因或是找出基因的作用。每个基因组数据库都是可搜索的。通常,科学家可以用几种不同的方法搜索数据库。通常,他或她可以输入他或她已经测序的基因序列,然后,数据库会找到一个或多个相似的序列进行比较搜索数据库的一种更简单的方法是查找基因关键字,例如基因的名称。美国国家生物技术信息管理局(NCBI)等权威机构可以给出序列不同的参考号,遗传学家也可以使用这些标识符中的一个来搜索基因组数据库。他或她也可以使用更多的搜索参数来缩小搜索范围。交叉引用信息是大多数基因组数据库的一个特点,一个单一的序列结果也将为数据库用户提供有用的链接,以获取更多的遗传信息。除了关于特定序列的信息外,许多数据库还提供了该序列和该区域显著特征的可视化表示一些不同的物种数据库可以包含不同的物种数据库,但是这些数据库可以包含更多的物种控制数据库,欧洲生物信息学研究所,甚至个别大学。
  • 发表于 2020-08-25 03:50
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  • 分类:科学教育

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