什么是亚硫酸氢盐测序(Bisulfite Sequencing)？
亚硫酸氢盐测序是一种利用甲基化分析DNA不同区域的方法。甲基化是在核苷酸中加入一种称为甲基基团的特定分子的过程，在这种情况下通常是一个胞嘧啶。不活跃的核苷酸通常被甲基化，因此这种方法可以用于各种目的，在亚硫酸...
亚硫酸氢盐测序是一种利用甲基化分析DNA不同区域的方法。甲基化是在核苷酸中加入一种称为甲基基团的特定分子的过程，在这种情况下通常是一个胞嘧啶。不活跃的核苷酸通常被甲基化，因此这种方法可以用于各种目的，在亚硫酸氢盐测序中，甲基化胞嘧啶不受测序过程的影响，而非甲基化胞嘧啶则转化为尿嘧啶，而尿嘧啶是一种在遗传物质脱氧核糖核酸（DNA）中不常见的核苷酸
DNA是一种天然的双螺旋结构的化学链，这种方法对甲基化的变化非常敏感，因此，结合的微小变化可以给研究人员提供有关特定核苷酸的特定信息。亚硫酸氢钠将胞嘧啶转化为尿嘧啶，但这种转化发生在甲基化胞嘧啶不会发生这种变化的环境中。当亚硫酸氢钠测序完成后，原始的DNA已经被转换成一个显著不同的分子。胞嘧啶将被大大耗尽或可能消失。如果在这个转换的分子中仍然发现一个胞嘧啶，它代表了正在考虑的基因组中的一个自然甲基化的胞嘧啶
在亚硫酸氢盐测序中，科学家使用甲基化来分析DNA的不同区域像所有的实验方案一样，亚硫酸氢盐测序也有缺点。它最大的缺点是它需要很高的盐浓度才能正常工作。盐会促使单链DNA退火成更自然的双螺旋，而亚硫酸氢钠作为双链DNA的一部分时，并不总是能到达细胞分裂素，如果盐浓度过高，许多细胞质可能无法转化为尿嘧啶，导致对基因组中甲基化胞嘧啶的错误鉴定。变性剂可能是减少假阳性鉴定的必要手段。大量的基因组数据对亚硫酸氢盐测序是不必要的，因此，该方法在临床标本分析中有很好的应用价值，其来源不重要，但必须是DNA，理论上可以用这种方法对核糖核酸（RNA）进行测序，由于大多数RNA都是单链的，由于核苷酸被阻断，因此不易出现假阳性。然而，在实际应用中，亚硫酸氢盐测序对RNA是没有用的，因为RNA中自然含有尿嘧啶。如果没有某种外部标记或附加到协议中，转换的胞嘧啶与天然尿嘧啶是无法区分的。当进行任何类型的测序方法时，精确性和精确性是至关重要的，像亚硫酸氢盐测序这样敏感的方法提供了一种可靠的序列分析方法，这反过来又允许基因分析和识别药物和治疗的靶点虽然这种方法不能用在活人身上，但它仍能对只有最小的组织样本起到很大的帮助。
DNA是一种天然的双螺旋结构的化学链，这种方法对甲基化的变化非常敏感，因此，结合的微小变化可以给研究人员提供有关特定核苷酸的特定信息。亚硫酸氢钠将胞嘧啶转化为尿嘧啶，但这种转化发生在甲基化胞嘧啶不会发生这种变化的环境中。当亚硫酸氢钠测序完成后，原始的DNA已经被转换成一个显著不同的分子。胞嘧啶将被大大耗尽或可能消失。如果在这个转换的分子中仍然发现一个胞嘧啶，它代表了正在考虑的基因组中的一个自然甲基化的胞嘧啶在亚硫酸氢盐测序中，科学家使用甲基化来分析DNA的不同区域像所有的实验方案一样，亚硫酸氢盐测序也有缺点。它最大的缺点是它需要很高的盐浓度才能正常工作。盐会促使单链DNA退火成更自然的双螺旋，而亚硫酸氢钠作为双链DNA的一部分时，并不总是能到达细胞分裂素，如果盐浓度过高，许多细胞质可能无法转化为尿嘧啶，导致对基因组中甲基化胞嘧啶的错误鉴定。变性剂可能是减少假阳性鉴定的必要手段。大量的基因组数据对亚硫酸氢盐测序是不必要的，因此，该方法在临床标本分析中有很好的应用价值，其来源不重要，但必须是DNA，理论上可以用这种方法对核糖核酸（RNA）进行测序，由于大多数RNA都是单链的，由于核苷酸被阻断，因此不易出现假阳性。然而，在实际应用中，亚硫酸氢盐测序对RNA是没有用的，因为RNA中自然含有尿嘧啶。如果没有某种外部标记或附加到协议中，转换的胞嘧啶与天然尿嘧啶是无法区分的。当进行任何类型的测序方法时，精确性和精确性是至关重要的，像亚硫酸氢盐测序这样敏感的方法提供了一种可靠的序列分析方法，这反过来又允许基因分析和识别药物和治疗的靶点虽然这种方法不能用在活人身上，但它仍能对只有最小的组织样本起到很大的帮助。
- 发表于 2020-08-05 17:48
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