有许多黑猩猩和人类之间的过渡化石的例子。第一个明显的过渡化石是Pikaia gracilens,在伯吉斯页岩(5.05亿年前)和澳大利亚弗林德斯山脉(5.6亿年前)发现的一种简单的类似柳叶刀的有机体。Pikakia是无脊椎动物和脊椎动物(脊索动物)之间的过渡化石,显示出原始脊索,脊椎动物脊骨的前体。琵琶平均长度为1.5英寸(5厘米),在海底游动,很可能以微型动物和食物颗粒为食。琵琶石化程度相对较差,目前只发现了60个标本。
因为它们兼具原始和高级特征,直立人的遗骸被认为是过渡化石。后来的过渡化石是叶鳍鱼,生活在大约3.75亿年前的泥盆纪晚期的原始四足动物,这种动物至少在陆地上进行有限的觅食活动。tiktalik被认为是鱼类和四足动物之间的过渡化石,因为它表现出两者的特点,tiktalik和类似的化石被称为"鱼足类"另一种最著名的过渡化石是始祖鸟,它介于鸟类和恐龙之间。始祖鸟生活在1.55亿至1.5亿年前的侏罗纪晚期。第一具完整的骨骼于1862年公布,该物种成为进化论的重要证据始祖鸟在幼年时期可以长到0.5米(1.6英尺),尽管表面上与鸟类相似,但实际上与小型兽脚类恐龙有着更多的共同点。在人类和我们的直系祖先黑猩猩之间发现了许多过渡性化石。由于这些物种的生存时间相对较近,只有在过去的几百万年里,这些化石往往比那些更古老的化石保存得更好。能人和直立人是这类过渡化石的两个常见例子,它们告诉我们很多关于原始人的进化。
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