细胞因子风暴可能是高传染性病毒(如流感)最严重症状的原因。这些蛋白质在免疫反应中的作用是复杂的。单个细胞因子可以影响几种不同类型的细胞,并且可以发挥一种功能,而几种不同的细胞因子可以发挥相同的功能,不同类型的细胞对同一种细胞因子的反应是不同的,细胞因子可以以不同的方式相互作用,例如,一种可能抑制另一种细胞因子的作用;两种细胞因子共同作用可能产生协同效应;一种细胞因子可以刺激其他细胞的产生。细胞因子可以影响产生它们的细胞——这些细胞被称为自分泌——或者它们可以影响附近的细胞——这些被称为旁分泌。不太常见,它们可能通过血流影响远处的细胞,这些细胞被称为内分泌。
内源性热原通过影响下丘脑的温度控制而引起发热和炎症反应。许多不同的细胞因子与先天免疫系统有关趋化因子通过趋化作用影响免疫细胞的运动,并能将这些细胞吸引到损伤或感染的部位,通过影响下丘脑的温度控制和促进脂肪和蛋白质分解产生热量,引起发热和炎症反应;它们还刺激趋化因子的产生。干扰素有多种功能,与此相反,白细胞介素10(IL-10)对免疫反应有本质上的抑制作用。其他类型的细胞因子在适应性免疫系统中起作用。白细胞介素2,4和5(IL-2,IL-4和IL-5)刺激多种免疫细胞的生长发育,转化生长因子β(TGF-β)主要是功能上的抑制,影响各种免疫细胞的增殖,并通过阻断内源性热原的作用来降低发热,干扰素γ(IFN-γ)在先天性和适应性中都有活性免疫反应。在骨髓中,另一组细胞因子起着重要作用。这一组细胞因子刺激血液循环,即骨髓白细胞的生长和成熟成不同类型。例如白细胞介素3和7(IL-3和IL-7),尽管这些蛋白质在协调免疫反应以消除威胁方面起着至关重要的作用,但它们有时会加重由病原体引起的疾病或导致疾病本身。细胞因子的过度产生,也许是对一种新的和不熟悉的病原体的反应,会导致细胞因子风暴,导致严重的危及生命的组织炎症有人认为1918年流感大流行期间的高死亡率是由于这种影响,而不是病毒本身的直接影响,过敏症和自身免疫性疾病。一些癌细胞会产生有助于刺激其生长的细胞因子。
细胞因子风暴是人体对感染的过度反应。
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