什么是Contig(Contig)？

contig是contig的缩写，是指脱氧核糖核酸（DNA）片段或重叠片段的产物，这些片段形成一个连续、广泛、不间断的DNA序列。通过研究这些片段的图谱，可以发现包含各种序列的片段的顺序，并且可以添加、删除contigs，或者重新排列以形...

contig是contig的缩写，是指脱氧核糖核酸（DNA）片段或重叠片段的产物，这些片段形成一个连续、广泛、不间断的DNA序列。通过研究这些片段的图谱，可以发现包含各种序列的片段的顺序，并且可以添加、删除contigs，或者重新排列以形成新的序列。DNA连接性图谱和文库使研究人员能够识别可能导致疾病的排列，更好地了解细胞在特定条件下的反应，使研究人员能够识别可能导致疾病的排列。基因组连接通过重叠匹配的序列标记集或匹配表达的序列标签相互连接构建块法：由DNA片段的碱基组成的程序，contigs可以复制或克隆成需要的序列，增加或消除不太有利的片段。研究人员将这些序列视为高度详细的计算机化DNA程序上的地图。该程序提供了用于构建片段的碱基的可视分解，以及用于构建特定序列的片段。使用不同的颜色方案，不同的contig程序将这些信息显示为低、中、高质量的序列。contig映射经常揭示遗传疾病的原因。例如，威廉姆斯综合征在儿童中会产生多系统症状，包括心血管问题，血钙水平升高，以及发育不良。研究人员发现了影响某些基因的条带缺失，这可能是由不适当的重叠引起的另一种儿童遗传性疾病，cri-du-chat综合征，也会产生多种症状，科学家认为每一种症状都与缺失和异常定位有关。研究人员还分析了植物物种中的contig序列。每种植物都含有该植物特有的序列，并通过获得各个植物物种的图谱，科学家们发现了可能导致某一特定植物类型的健康或退化的相似和不同的特征，医生可以确定可用于治疗发展的性状。绘图通过序列删除或克隆提供了对可能的基因操纵的直观见解。科学家可以在细菌人工染色体、酵母人工染色体中培育克隆的DNA样本，或在P1或噬菌体人工染色体培养基中。这些染色体含有50到数十万个碱基，这些碱基组成连续的片段。在定殖一段时间后，用注射器提取样本并放入DNA测序凝胶中，经过电泳和干燥后，放射自显影仪读取样本并在序列上留下指纹。研究人员随后将指纹扫描到图像文件中，然后将其加载到contig程序中

发表于 2020-09-07 11:18
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分类：科学教育

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