新冠疫情下美国的病毒检测是怎样的?

疫情暴发后,想要节制疾病传布,最主要的莫过于将病毒检测的假阴性率降至最低。在今天登载的几篇日志中,史隽教员记实阐发了关于病毒检测的诸多信息。

撰文 | 史隽

原题目:《117疫情不雅察 | 史隽·波士顿篇·Ⅱ》

3月25日 周三

MA累计确诊 1838例

昨晚睡觉前听到哥伦比亚大学闻名风行病学家W. Ian Lipkin传染了新冠病毒的动静,很是震动。

来历:NBC news

Lipkin传授被称为宿世界领先的“病毒猎人 (virus hunter)”。他仍是史蒂文·索德伯格(Steven Soderbergh)2011年的片子《流行症》(Contagion)的首席科学参谋。

在2003年非典期间,他受中国科学家和当局官员的邀请来到中国,帮忙拟定了节制病毒传布和削减传染的策略。2003年4月,他直接从患者的肺组织中测序出一段SARS冠状病毒 (SARS-CoV-1) 的序列而且研发出了首个针对SARS冠状病毒的敏感诊断测试。钟南山院士就是在他的建议下,把非典界说为病毒传染,改变了国内按细菌来治疗的政策。

非典事后,他与中国的科学家和当局官员合作无懈,帮忙中国增强公共卫生系统。他帮忙成立了上海的巴斯德研究所、海说神聊京的新国度疾病节制中间和广州市生物医学与健康研究所。

此次1月底2月初,他也去了中国。固然不克不及去武汉,仍是在广州和海说神聊京呆了一段时候。

钟南山院士和Lipkin传授在广州机场 (来历:哥伦比亚大学官网)

来历:China Daily

我记得很清晰,2月17日下班开车回家,听到了美国电台NPR对他的采访。那是他回到纽约,在家隔离的最后一天。采访里他说:新冠病毒和SARS病毒一样,发源于野活泼物;测序成果表白它可能来自蝙蝠,经由过程某种中心宿本家儿,可能是小型哺乳动物,传染到人。他还强调了,今朝没有证据证实这种病毒可能发源于生物尝试室或者是某种生物兵器。

他认为当前最主要的工作是研发一个活络的检测方式,可以找出无症状传染者,而不是用辐射很大的CT来检测病人。这样才能有用的节制扩散。

此刻的大大都测试只能用于已经生病并呈现症状的患者,只有这类患者才能测得精确成果。

就在3月19日,Lipkin传授的团队颁布发表研发出了一个敏感的测试方式,可以检测到无症状或者轻症状COVID-19患者体内的少量病毒。主要的是,这种被称为C3 (CII COVID-19Coronavirus Assay) 的新测试可以削减假阴性和假阳性率,不仅削减了不知不觉传布病毒的人的数目 (假阴性),并且削减了不需要的医疗资本华侈 (假阳性,即隔离或治疗因其他原因生病的人)。可惜该测试固然活络,但今朝仅限于研究利用,还没有大规模用于排查。

最小化假阴性率对于节制疾病传布至关主要。这个新检测法对新冠病毒的特异性很高,不会与其他病毒发生交叉反映,从而导致假阳性,导致不需要地隔离患者。

他认为今朝节制疫情最好的东西是隔离 (isolation) 和限制 (confinement)。

Lipkin传授在接管采访的时辰说:“若是我会传染新冠病毒,那么谁都有可能会传染。”

If it can hit me, it can hit anybody. That’s the message I want to convey.

1952年出生的Lipkin传授已经68岁,但愿他能早日康复。

马萨诸塞州简直诊人数俄然增添了良多,似乎已经进入指数增加期。州长颁布发表黉舍将一向封闭到5月4日。

FDA又告急核准利用了两个COVID-19诊断测试:

1) 由Mesa Biotech公司开辟的手持式仪器 (见下图)

2) 由BioMérieux的子公司BioFire与美国国防部合作开辟的全主动检测法,可以在约一个小时内供给成果。

来历:FierceBiotech

https://www.fiercebiotech.com/medtech/fda-authorizes-hand-held-covid-19-diagnostic-test

同时,FDA也发警告提醒大师:

消费者应谨严采办或利用卖方声称有助于诊断、治疗、治愈或预防COVID-19的产物。

今朝尚无FDA核准的预防或治疗COVID-19的疫苗和药物。

利用欺诈性的产物可能会导致人们延迟或遏制恰当的治疗,并可能危及生命。

来历:CNBC

https://www.cnbc.com/2020/03/25/fda-warns-consumers-against-fraudulent-coronavirus-tests-vaccines-and-treatments.html

3月26日 周四

MA累计确诊 2417例

Trump昨天发了一条twitter,说:“到今朝为止,美国做的‘新冠病毒测试’已经远远跨越任何其他国度!现实上,在曩昔八天的时候里,美国进行的测试要比韩国(曩昔被认为长短常当作功的测试的国度)在八周的时候内做的测试更多。“

在之后的新闻发布会上,他又把这点说了好几遍。

然而,总统做的比力并不科学。风行病学家做比力凡是利用的是人均检测率,测试的绝对数目不是很有意义。

尽管美国在冠状病毒检测的总数上跨越了韩国,但鉴于美国生齿是韩国的六倍多,是以美国的人均检测量却少得多。

截至昨天 (3月25日),按照韩国CDC的陈述, 5100万生齿的韩国进行了357,896项新冠病毒测试。(数据来历:https://www.cdc.go.kr/board/board.es?mid=a20501000000&bid=0015)

比拟之下,美国根基属于各州自治,每个州零丁统计报告请示本身的测试数据,有几个州不陈述阴性成果数目或成果待定的测试数目,所以很难精确地统计美国到底有几多人接管了新冠病毒测试。

《大西洋》(The Atlantic)杂志的撰稿人Alexis Madrigal带领了一个有100多名当作员的义工小组,汇总了各州当局网站和当局官员供给的数据,报告请示在Covid Tracking Project上。按照他们的统计,截至昨天 (3月25日), 3.29亿生齿的美国进行了至少418,810项新冠病毒测试。(数据来历:https://covidtracking.com/data/)

按照这些数据,韩国的人均检测率是1/142,而美国只有1/786。

要达到韩国测试的笼盖面,美国还要测良多才够。

师兄发来他在超市买工具的照片,列队结账每人世隔至少2米,落实了媒体天天絮聒的“social distancing”。

摄影 | 安德鲁鱼

3月27日 周五

MA累计确诊 3240例

FDA又告急核准利用了一个新的检测方式:由雅培 (Abbott) 公司开辟的、今朝最快的新冠病毒测试 (Abbott ID NOWCOVID-19 test),阳性成果5分钟可以读出,阴性成果13分钟可以读出,并且体积小巧便携,几乎可以在任何医疗情况中利用。

该手艺基于雅培的ID Now平台。这个平台是美国今朝最常用的即时查验仪器,全美大约有18,000多个这样的重量不到7磅的小机子,普遍用于检测流感、链球菌性喉炎 (strep throat) 和呼吸道合胞病毒 (respiratory syncytial virus,一种引起伤风症状的常见病毒)。

上周,雅培公司的m2000 RealTime系统也获得了美国FDA的告急核准利用, 用于病院和分子尝试室诊断传染。这个系统每周最多可以进行100万次测试,可是需要的时候更长。

雅培公司打算从4月1日起头天天供给50,000个ID Now测试,两个系统加起来,每月至少供给500万次测试。

ID Now系统是雅培公司2016年2月份收购的Alere公司开辟的。其检测道理是:将病人的鼻或咽拭子样本与化学溶液夹杂,病毒分裂从而释放RNA;将这个夹杂物插入ID Now系统中,经由过程等温核酸扩增手艺连系转录介导,可以定性测微量的RNA,扩增大约150碱基的小段,这一小段是新冠病毒的特异序列,分歧于其他病毒。若是样本里面有新冠病毒,扩增5分钟今后就能发生足够的旌旗灯号,可以判定为阳性。而若是扩增13分钟今后仍然没有旌旗灯号可以判定为阴性。

和师兄们研究了一晚上这背后的黑科技,最后仍是有些细节不甚大白。感受固然速度快,但不如传统的RT-PCR方式严谨,没有一个很好的control来确保取样过程可能会有的问题,假阴性率也会高一些。

但不成否定,即时临检 (Point-of-care testing) 在疫情大面积暴发的时辰仍是有很大的优势的。

雅培病毒检测机 (来历:Abbott Laboratories雅培尝试室)

-未完待续-

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  • 发表于 2020-04-06 02:00
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