在遗传学中,什么是散弹枪方法(In Genetics, what is the Shotgun Method)?

鸟枪法用于对脱氧核糖核酸(DNA)分子的长链进行测序。它依赖于另一种称为链终止法的DNA测序方法。利用鸟枪法,科学家对DNA链的部分进行测序,并利用结果创建一个连续的序列。 鸟枪法在很大程度上被其他类型的测序所取代。测...
鸟枪法用于对脱氧核糖核酸(DNA)分子的长链进行测序。它依赖于另一种称为链终止法的DNA测序方法。利用鸟枪法,科学家对DNA链的部分进行测序,并利用结果创建一个连续的序列。鸟枪法在很大程度上被其他类型的测序所取代。测序是指找到一个分子的原子组成并研究结合这些原子的化学键的过程。在DNA中,测序是用来找出某些分子发生的顺序。这些分子被称为核苷酸。四种核苷酸碱基是腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶,科学家们用鸟枪法对DNA链的一部分进行测序。其中一种方法是利用鸟枪法对长链DNA进行测序。在这种方法中,DNA被分解成随机的片段。然后用一种叫做链终止法的方法对产生的片段进行测序。链终止法是选择短DNA序列的方法。它使用的化学物质很少,放射性比其他短序列法低。在链终止法中,一条链脱氧核糖核酸被分为四个测序反应。每一个反应都包含四个核苷酸和一个起催化剂作用的酶,称为DNA聚合酶。然后在每一个测序反应中加入一个双脱氧核苷酸,它基本上是糖序列中缺失的一部分核苷酸。处理完这些反应后,科学家们能够想象出在用鸟枪法测序的过程中,所有这些都是用不同的随机DNA片段进行的这会导致测序DNA的多个重叠部分。然后计算机程序使用重叠部分来创建连续的DNA序列。散弹枪法的问题是DNA非常复杂。通常,它包含的重复序列看起来是一样的,但来自DNA的不同部分。完整的人类DNA,称为人类基因组,拥有超过30亿个碱基对。确保重复序列位置正确的唯一方法是进行更多的随机读数,以便对每个部分进行多次测序。即使如此,也会出现错误。直到2005年,鸟枪测序法一直是DNA测序的前沿。从那时起,科学家们已经创造了下一代测序技术,它的工作速度要快得多。个体测序的准确性比鸟枪测序法要低,但是科学家们可以在更短的时间内完成更多的读数,从而弥补了这一点。鸟枪测序现在是多种基因组测序的首选方法。
  • 发表于 2020-09-08 03:25
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  • 分类:科学教育

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