什么是基因组浏览器(Genome Browser)？

基因组浏览器是一个网络界面，用来查看染色体的物理图。这张图显示了两个基因之间的DNA分离程度，以碱基对来衡量，人类染色体的大小从5000万到超过2.5亿个碱基对不等。基因组浏览器可以显示整个染色体的示意图，也可以"放大"...

基因组浏览器是一个网络界面，用来查看染色体的物理图。这张图显示了两个基因之间的DNA分离程度，以碱基对来衡量，人类染色体的大小从5000万到超过2.5亿个碱基对不等。基因组浏览器可以显示整个染色体的示意图，也可以"放大"单个基因的示意图，甚至是实际的碱基对序列

基因组浏览器是用于查看染色体物理图的web界面。基因组浏览器允许用户在染色体上滚动并放大某些特定的染色体位置。许多基因组浏览器允许用户在查看实际DNA序列的水平上进行放大，尽管浏览器的真正用途在于能够在更大范围内查看基因，而不是在核苷酸水平上查看DNA序列。一个基因的平均大小为3000个碱基对，因此，当放大到碱基对水平时，用户看到的不到一个完整的基因。人类最大的基因dystrophin有240万个碱基对用户可以在染色体上滚动并放大某些位置。除了查看基因的示意图外，基因组浏览器还可以显示其他有用的信息这可以包括被翻译成蛋白质的基因部分，称为mRNA，以及除了编码蛋白质以外还有其他功能的DNA序列。基因组浏览器还可以显示在基因组测序过程中使用了哪些DNA片段大量的有机体已经对基因组进行了测序。基因组学领域没有一个标准的浏览器，因此基因组浏览器可能在测序的基因组之间有所不同。基因组浏览器具有搜索感兴趣的基因或序列的功能，允许用户从一个基因组位置跳转另一方面，由于大多数染色体的体积非常大，在染色体上滚动以找到感兴趣的位置是没有效率的。一些基因组浏览器有一个叫做基因分类的工具。这个工具显示一个基因表这种关系可以是几种类型中的一种：序列同源性、相似的表达谱或基因组相似性。用户使用一个词或短语搜索一个基因，选择他或她想要的关系类型，然后基因分类器显示搜索结果。

发表于 2020-08-24 16:00
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分类：医疗卫生

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