衣原体是最常见的性传播感染之一，有几种抗生素可用于治疗。最流行的两种衣原体药物是强力霉素和阿奇霉素，被认为是最有效的抗生素。氧氟沙星和左氧氟沙星通常也能成功地消除感染，但它们往往比前两种药物贵。孕妇在使用衣原体药物时通常不得不使用其他选择，因为最流行的治疗方法之一，强力霉素在怀孕期间并不安全，因此，孕妇更有可能服用红霉素或阿莫西林。
某些衣原体药物对孕妇不安全。
强力霉素长期以来都是衣原体的首选药物，因为研究表明，它在根除该病方面是最成功的。它通常是最便宜的衣原体药物，但它的缺点之一是需要每天服用两次，持续7天。孕妇或哺乳期的患者不能服用，因为它对未出生的婴儿和婴儿来说是不安全的，相反，这类患者可以服用阿奇霉素，这是治疗衣原体的第二大热门药物，它的主要好处是患者只需服用一剂就可以消除感染，但缺点是服用这种药物后，她们必须等待一周才能进行性交。
阿莫西林是另一种药物一种衣原体药物，虽然它被认为和强力霉素和阿奇霉素一样有效，但通常更昂贵这是医生不常给药的主要原因。与强力霉素一样，氧氟沙星需要每天服用两次，持续一周，孕妇和哺乳期妇女不能服用。左氧氟沙星是一种类似的药物，有时会被其他衣原体药物替代，但它通常和氧氟沙星一样贵。
通常，治疗孕妇衣原体的药物在治疗感染方面不如其他抗生素有效。
阿奇霉素只是被认为在怀孕期间安全使用的衣原体药物之一，但也有更便宜的选择。医生也可能会开一些便宜的阿莫西林，尽管这类青霉素很少用于未怀孕的患者，因为它不如其他衣原体药物有效。另一种廉价且对孕妇有效的选择是红霉素。红霉素被认为是最不受欢迎的衣原体药物之一，因为它需要一年服用四次多西环素是用来治疗衣原体的抗生素之一。