在实验室结果出来之前,从喉咙后部采集的样本可以生长几天一旦细菌被培养出来,各种各样的工具就可以用来为它的身份提供线索。最基本的一种是革兰氏染色法,它用化学染色法将细菌分为革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。其他染色剂可以用来增强对比度,使细菌更容易在显微镜下看到。显微镜下的视觉鉴定通常可以通过熟悉的细菌种类来完成,特别是那些形状独特的。细菌鉴定库里有更多的工具。研究人员可以使用血清学方法,基因测序包括将一个未知细菌的样本暴露于各种抗体中,看看是否有一种反应或基因测序,在这种反应中,细菌的遗传密码被解开。基因测序还可以用来区分两种密切相关的细菌菌株,提供一种菌株对某一种特定菌株产生反应的原因药物治疗的过程,而另一个没有。也可以研究对各种化学物质和刺激的反应,如紫外线辐射。细菌鉴定通常在实验室进行,因为实验室有医疗设备、化学药品和在追踪细菌身份过程中使用的工具。一些实验室专门培养和鉴定医院和诊所的样本,而其他实验室则专注于研究,识别新的和未知的细菌样本,以便对它们进行分类严格控制实验室环境,防止实验室工作人员受到污染和意外感染,在高安全性的实验室里,科学家们正在研究具有特殊毒性的生物体,这些实验室为科学家们提供了几层保护。
熟悉的细菌通常可以通过形状来识别。
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