线粒体是真核生物的一个决定性的细胞器。此外,真核生物细胞可能有一系列用于运动或保护的表面特征,这在原核生物中是没有的,例如鞭毛,例如在人类精子中发现的鞭毛,以及在植物中发现的细胞壁真菌细胞有一个几丁质细胞壁,这是昆虫用来做外骨骼的材料。像蘑菇这样的真菌接触起来不会感觉很硬,因为它们的甲壳素壁的厚度远小于昆虫和其他兽脚类动物的甲壳素外骨骼
红藻被认为是最早的真核生物之一,可追溯到12亿年前。真核生物比原核细胞具有更大的复杂性和多样性。真核细胞中的一些细胞器实际上是原核生物的祖先,它们曾经与真核生物有共生关系,但后来被真核生物吸收了。例如线粒体和叶绿体。线粒体甚至有自己的DNA,随着进化时间的推移,这些DNA已经慢慢转移到保护较好的细胞核中真核生物在地球上的生命中比原核生物更近。原核生物在34-27亿年前进化,真核生物在21-16亿年前进化,尽管一些证据表明可能起源于27亿年前。最早的真核生物化石可以追溯到12亿年前,以红藻的形式存在,海藻的一种。
细胞器区分真核生物和原核生物。
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