为什么说群体免疫还远着呢？

只有大规模排查，才能告诉我们全平易近传染的真实数据，并估算无症状传染率。

撰文 | 史隽

4月17日周五

MA累计确诊 34402例

自1月底国内疫情暴发以来，就看着微信群里各类谣言漫天飞。有一段时候和伴侣说笑，学生物的人比来日子过得累，白日上班，晚上还要在各个微信群帮着辟谣。

日志里提到过的西雅图弗雷德·哈钦森癌症研究中间 (Fred Hutchinson Cancer Research Center) 的病毒基因学专家Trevor Bedford也不克不及免俗，上周日连发18条推文就为了辟谣。

这条谣言是：加州2019年秋天到2020年头的流感其实是COVID-19，所以加州今朝有群体免疫，疫情没有此外州严重。

在国内也可以看到不少文章介绍这个“理论”。

Trevor认为，这种猜测和数据不合适。

他介入的Seattle flu project （西雅图流感打算）收集了西雅图地域有急性呼吸道传染的人的鼻拭子样本。这些人中一部门有流感样疾病，若是是新冠病毒传染，也会因为症状合适前提被采样。

比来，他们检测了这些收集的样本里是不是有新冠病毒。

在一月份收集的3600个样本里面0个是新冠病毒。在二月份收集的3308个样本里面，最早的新冠样本在2月21日被采集到，之后总共有10个样本是新冠测试阳性。这个故事我在以前一篇日志里面特意讲过 (见《117疫情不雅察：新冠无症状传染的威胁 | 史隽·Ⅲ》)。

此外，2019年10月到2020年2月的样本里面有各类各样的病毒，包罗流感病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、间质肺病毒和通俗的季候性冠状病毒 (包罗4种：229E，NL63，OC43和HKU1) 。

通俗的季候性冠状病毒引起的伤风约占伤风的30％，在分子测定法中很轻易与新冠病毒区分隔，没有混合的可能性。

是以可以推论，2019年10月至2020年1月的西雅图流感并非是新冠病毒风行造当作的。考虑到西雅图地点的华盛顿州和加州之间的慎密观光联系，新冠病毒不成能在加州普遍传播，却不传布到华盛顿州。

然而，因为有无症状和轻症状传染者的存在，没有大规模的血清学测抗体的数据，很难精确的估量COVID-19患者的总数。Trevor猜测，今朝确诊的病例是现实总传染人数的5% -10%，是以美国大约有2% -3%的人传染过新冠病毒。

然而，美国CDC最新计较出的R0值是5.7，这就意味着需要大于

的人传染事后有抗体才能达到群体免疫。美国离群体免疫的方针还差很远。

加州的疫情没那么严重，是因为防控工作做得比力到位，而不是因为群体免疫。Trevor Bedford作为作者之一的两篇预印本文章就比力了海说神聊加州和西雅图的病毒传布的分歧之处。经由过程对良多COVID-19患者携带的病毒测序，研究人员发现，海说神聊加州的新冠病毒有多个输入源。而西雅图只有一个输入源，就是那位从武汉投亲回西雅图的Amazon的程序员，4周里默默地传布了整个社区，直到本地疫情暴发。

Trevor Bedford的两篇文章：

Cryptic transmission of SARS-CoV-2 in Washington State

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.02.20051417v1

A Genomic Survey of SARS-CoV-2 Reveals Multiple Introductions into Northern California without a Predominant Lineage

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.27.20044925v1

至于怎么估算现实的新冠病毒传染者的总数，Trevor在4月7日的9条推文中讲过。

传染病毒今后大约在第6天人会发生抗体，即使恢复今后，抗体仍然可以在体内存在好几个月 (新冠病毒到底可以或许存在多久的具体数据还没有，良多猜测是6-12个月) 。因为有无症状或者轻症状传染者的存在，要知道人群中到底有几多人曾经传染过新冠病毒，经典的检测方式就是测血液里可以连系新冠病毒的特异抗体。

近似的“血清阳性率”也曾用于早期的一些流行症研究。例如猪流感 (swine flu) 风行后一年，抗体检测发现全宿世界约35％的人传染过这个病毒（https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0020358）。

而Zika病毒在巴西东海说神聊部大风行时代约传染了本地60％的生齿。(https://mbio.asm.org/content/8/6/e01390-17.short)

有一个研究按照欧洲列国传染和灭亡总数，猜测列国新冠病毒现实传染者占总生齿的比例在1％至15％。

截至2020年3月28日，模子估算的欧洲列国现实传染过新冠病毒的人数百分比。（https://imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/covid-19/report-13-europe-npi-impact/）

在美国，比来加州有两个研究团队做了两个小规模的抗体测试。

第一个社区测试是在加州海说神聊部的Santa Clara County (圣塔克拉拉县) 进行的，很多科技公司的总部都设在这里。这个测试招募了社区里没有被确诊过的3,300位居平易近，用的一家生物手艺公司Premier Biotech供给的试剂盒，发现被测试者中有2.5％至4.2％的抗体检测是阳性。这个数据再次证实海说神聊加州离群体免疫还差的很远。

圣塔克拉拉县的总生齿是200万，用这个数据推算，可能传染过新冠病毒的人数在48,000至81,000之间。而在抽样的4月4日至5日，该县的官方确诊人数大约只有1,000人。这意味着圣塔克拉拉县的传染过新冠病毒的人数是官方确诊数字的50到80倍。

可是有几点提醒大师注重：

1）这个排查的采样量还不是很大。

2）圣塔克拉拉县的成果并不克不及推广到美国所有的地域。

3）这个试验是在收集上招募自愿者的，自愿者不克不及算是整个社区居平易近的典型代表，因为社区里并不是所有人城市上彀存眷这类告白。

随后还需要进一步阐发，才能知道有几多抗体检测阳性的人因为无症状，因而从不知道本身曾传染过病毒。

南加州大学 (University of Southern California) 的另一个团队正在加州南部的洛杉矶地域进行近似的抗体检测。

而美国CDC也在进行大规模的抗体测试，包罗三个排查：

第一个是在疫情严重的地域抽查没有被确诊过的人；第二个是全国的排查；第三个是医护人员的排查。（见今天的头条则章）

但愿很快能看到这些测试的成果，从而能知道全平易近传染的真实数据，而且估算无症状传染率。

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